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平台介绍
快速和低成本获得特殊或高比例代谢产物的精确结构非常具有挑战性,药明康德代谢产物生物合成及其结构鉴定实验平台可提供基于代谢产物结构鉴定的体内外生物合成技术,即采用体外孵育或动物给药的手段,结合制备液相分离、高分辨质谱(HRMS)和核磁鉴定技术(NMR)实现定向高效合成目标代谢产物并鉴定其精确结构。该技术具备以下优点:1)可准确定向合成,无需与体内外样品中的目标代谢产物进行多次匹配;2)化学合成困难时,可作为其替代方案;3)流程相对简单,实验周期短。
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流程图
代谢产物生物合成流程图
代谢产物的生物合成流程主要包括实验体系的优化(动物种属、基质种类和实验条件的筛选)和放大,目标代谢产物的分离纯化,和高分辨质谱(HRMS)及核磁(NMR)结构鉴定。
案例分享
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卡巴折伦氧化代谢产物的生物合成案例
卡巴折伦在人肝细胞中生成了一个高比例(占比约为60%)的单氧化代谢产物(图1A),通过比较卡巴折伦在肝微粒体、S9和肝细胞中的代谢物谱,推测该单氧化产物为AO酶催化产物。综合考虑实验基质来源的便捷性和项目成本,选择了富含AO酶的猴肝细胞质孵育体系来进一步优化实验条件(图1B),最终超过90%的卡巴折伦代谢为单氧化产物,采用制备液相分离纯化后得到单氧化产物标准品,最后通过NMR(图2 和图3)鉴定该单氧化产物的结构为7-氧-卡巴折伦。
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卡巴折伦在人肝细胞中孵育2 h(A)和猴Cytosol孵育4 h(B)后的LC-UV图谱
图 1
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卡巴折伦的1H NMR图谱
图 2
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7-氧-卡巴折伦的1H NMR图谱
图 3
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优势
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完善的体内外代谢物生物合成平台
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可定向合成
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实验周期短
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基于客户要求定制交付服务内容
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10+年代谢产物生物合成经验
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50+累积完成项目
常见问答
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生物合成项目的实验周期一般是多久?
生物合成项目的实验周期一般是4-6周,包括前期的方法优化1-2周,目标代谢产物的放大合成、分离纯化和核磁结构鉴定3-4周。
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代谢物生物合成的交付结果是什么?
基于实验需求不同,有以下三种交付成果,1)基于HRMS和NMR的代谢物精确结构,2)代谢物标准品(粉末或溶液),3)基于HRMS和NMR的代谢物精确结构+代谢物标准品(粉末或溶液)。
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代谢物精准结构鉴定的主要挑战是什么?
代谢物精确结构鉴定主要依赖高质量的HRMS数据和NMR数据,而代谢物标准品是获得HRMS数据和NMR数据的前提。由于生物样品(体外孵育体系或是动物排泄物)中基质复杂,代谢物浓度低且结构未知,如何获得足量的代谢物并分离纯化得到mg级高纯度的标准品是非常具有挑战性。基本代谢产物生物合成平台,可以高效的合成代谢物标准品并实现代谢物结构的精准鉴定。
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